在2018年的中國網絡審查中，愛神巧克力遭到舉報， 並且命令下架整改， 目前大陸的影片平台如BiliBili、騰訊動漫等已無法搜尋到，唯漫畫則不受影響，可以繼續觀看，但是在作者QQ群所說，本漫畫已經被鎖定，無法繼續更新，只能無限期停更（漫畫後續持續更新，已經完結）。
愛神巧克力被少部分中國家長認為會引導小朋友早戀， 而且傳播如後宮、 不務正業等不良意識。
除此之外，還有部分人質疑這部作品抄襲日本動漫作品約會大作戰， 然而有圈內人士指出這部作品的核心 以及構成等等都與約會大作戰無關， 只是巧合或借鑒。無很多的錨點
雖然有著種種的爭議， 但這部作品在圈内外也是獲得了極大的好評。
甚至令日本的網友認為中國的動畫開始崛起， 在劇情編排以及相關處理上都已經能趕上日本的腳步， 可見作品亦是有一定的影響力。